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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
05/11/2020 |
Data da última atualização: |
06/11/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LIMA, R. A. T.; OLIVEIRA, G. d.; SOUZA, A. A.; LOPES, F. A. C.; SANTANA, R. H.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; BARBOSA, J.; FREITAS, S. d.; GARAY, A. V.; KRUGER, R. H. |
Afiliação: |
Raul Alcântara Teixeira Lima, Universidade de Brasília; Gideane de Oliveira, Universidade de Brasília; Amanda Araújo Souza, Universidade de Brasília; Fabyano Alvares Cardoso Lopes, Universidade Federal do Tocantins; Renata Henrique Santana, Instituto Federal de Brasília; Paula Istvan, Universidade de Brasília; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; João Barbosa, Universidade de Brasília; Sônia de Freitas, Universidade de Brasília; Aisel Valle Garay, Universidade de Brasília; Ricardo Henrique Kruger, Universidade de Brasília. |
Título: |
Functional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020. |
Volume: |
165 |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification. |
Palavras-Chave: |
Genômica ambiental. |
Thesagro: |
Cerrado; Enzima; RNA. |
Thesaurus Nal: |
Beta-glucosidase; Metagenomics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02436naa a2200349 a 4500 001 2126334 005 2020-11-06 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236$2DOI 100 1 $aLIMA, R. A. T. 245 $aFunctional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri.$h[electronic resource] 260 $c2020 300 $a165 490 $v165 520 $aIn this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification. 650 $aBeta-glucosidase 650 $aMetagenomics 650 $aCerrado 650 $aEnzima 650 $aRNA 653 $aGenômica ambiental 700 1 $aOLIVEIRA, G. d. 700 1 $aSOUZA, A. A. 700 1 $aLOPES, F. A. C. 700 1 $aSANTANA, R. H. 700 1 $aISTVAN, P. 700 1 $aQUIRINO, B. F. 700 1 $aBARBOSA, J. 700 1 $aFREITAS, S. d. 700 1 $aGARAY, A. V. 700 1 $aKRUGER, R. H. 773 $tInternational Journal of Biological Macromolecules$gv. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Registros recuperados : 20 | |
2. | | SANTANA, R. H.; VERAS, H. C. T.; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. G. Análise experimental da expressão diferencial de um transcrito de soja identificado através de northern eletrônico. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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3. | | BONFIM, D. S.; SANTANA, R. H.; BARROS, L. M. G.; CARNEIRO, M.; ALMEIDA, J. D. Isolamento de promotores em café: o método Genome Walker. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 043. p. 83.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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6. | | SANTANA, R. H.; ALMEIDA, J. D.; CARNEIRO, V. T.; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. Identification of soybean organ-specific expressed genes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 104.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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7. | | SANTANA, R. H.; ALMEIDA, J. D.; CARNEIRO, V. T.; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. G. Identification of soybean organ-specific expressed genes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 104.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | MENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; SANTANA, R. H.; GLADDEN, J.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise funcional e da diversidade de um consórcio microbiano capaz de degradar lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 36.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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10. | | GARCIA, M. B.; MENDES, I. V.; SANTANA, R. H.; KRUGER, R. H.; GLADDEN, J.; QUIRINO, B. F. Diversidade microbiana e degradação de lignina em cultura enriquecida. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 42.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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11. | | CUNHA, M. J.; SANTANA, R. H.; VERAS, H. C. T; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G. Validação de um gene de Glycine max preferencialmente expresso em folha. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. p. 73.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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12. | | VERAS, H. C. T.; SANTANA, R. H.; ALMEIDA, J. D. de; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. G. Validação de um gene de soja (Glycine max) preferencialmente expresso em semente. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 040.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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13. | | VERAS, H. C. T.; SANTANA, R. H; ALMEIDA, J. D.; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. G. Validação de um gene de soja (Glycine max) preferencialmente expresso em semente. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. p. 74.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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14. | | SANTANA, R. H.; VERAS, H. C. T.; CARNEIRO, V. T. de C.; ALMEIDA, J. D.; ABDELNOOR, R. V.; BARROS, L. M. G. Analise experimental da expressão diferencial de um transcrito de soja identificado através de northern eletrônico. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. p. 45.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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15. | | SANTANA, R. H.; DA SILVA, G. H.; BARROS, L. M. G.; CARNEIRO, M.; MARRACINI, P.; ANDRADE, A. C.; ALMEIDA, J. D. Isolamento de promotores específicos de café. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 044. p. 84.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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16. | | GUIMARÃES, H. I. P.; SANTANA, R. H.; SILVEIRA, R.; PINTO, O. H. B.; QUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; BUSTAMANTE, M. M. da C.; KRÜGER, R. H. Seasonal Variations in Soil Microbiota Profile of Termite (Syntermes wheeleri) Mounds in the Brazilian Tropical Savanna. Microorganisms, v. 8, 1482, 2020. 8 Special Issue: Soil Microbiome: Biotic and Abiotic Interactions.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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17. | | CUNHA, M. J.; SANTANA, R. H.; VERAS, H. C. T.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G. Validação de um gene de Glycine max preferencialmente expresso em folha. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 039.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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18. | | MENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; BITENCOURT, A. C. A.; SANTANA, R. H.; LINS, P. de C.; SILVEIRA, R.; SIMMONS, B. A.; GLADDEN, J. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Bacterial diversity dynamics in microbial consortia selected for lignin utilization. PLoS ONE, v. 16, n. 9, e0255083, 2021. PDF: il. color.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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19. | | LIMA, R. A. T.; OLIVEIRA, G. d.; SOUZA, A. A.; LOPES, F. A. C.; SANTANA, R. H.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; BARBOSA, J.; FREITAS, S. d.; GARAY, A. V.; KRUGER, R. H. Functional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri. International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020. 165Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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20. | | COTTA, M. G.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J. D. de; SANTANA, R. H.; BARBOSA, E. A.; ALVES, G. S. C.; PAIVA, L. V.; CARNEIRO, M.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. Lipid transfer proteins in coffee: isolation of a Coffea Orthologs, Coffea Arabica Homeologs, expression during coffee fruit development and promoter analysis in transgenic tobacco plants. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 2012, San José. Proceedings... [S.l]: Association for Science and Information on Coffee (ASIC), 2012. p. 231.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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